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Evaluation économique des dommages liés à la contamination microbiologique des eaux côtières Le cas de la conchyliculture ArchiMer
Roncin, Nicolas; Kervarec, Fabienne; Boncoeur, Fabienne.
Tipo: Text Palavras-chave: Mussel culture; Monitoring; Contamination; Economic impact; Coastal water; Marine pollution; Shellfish culture; SEM; Conchyliculture; Developpement economique; Surveillance; Controle microbiologique; Contamination.
Ano: 2001 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2001/rapport-1739.pdf
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Evaluation of phenotypic tests to detect carbapenem-resistant Enterobacteriaceae in colonized patients hospitalized in intensive care units BJID
Perez,Leandro Reus Rodrigues; Rodrigues,Diógenes; Dias,Cícero Gomes.
In this study, we aimed to evaluate the performance of different phenotypic tests to detect carbapenem-resistant Enterobacteriaceae. Three different phenotypic methods were evaluated: (1) combined-disk test of meropenem plus phenylboronic acid or EDTA reading after 24 h and 48 h; (2) selective/chromogenic read after 24 h and after 48 h; and (3) overnight selective enrichment broth containing 10 µg ertapenem disk followed by culture on MacConkey agar. A positive result in at least one of the methods was submitted to PCR for blaNDM-1, blaOXA-48, blaKPC, blaSPM-1, blaIMP, and blaGES detection. Carbapenem-resistant Enterobacteriaceae was detected in 31 (30.4%) of 102 rectal swabs evaluated. All isolates showed to be KPC-2-producing organisms. Results showed...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/other Palavras-chave: Carbapenems; Enterobacteriaceae; KPC; Surveillance.
Ano: 2015 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1413-86702015000400436
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Evaluation of rapid tests for human immunodeficiency virus as a tool to detect recent seroconversion BJID
Girardi,Samira Barboza; Barreto,Angela Maria Egydio de Carvalho; Barreto,Claudia Cortese; Proietti,Anna Barbara; Carvalho,Silvia Maia Farias de; Loureiro,Paula; Sabino,Ester Cerdeira.
The identification of recent HIV infection is important for epidemiological studies and to monitor the epidemic. The objective of this study was to evaluate two rapid tests that are easily available to the Brazilian scientific community for using as markers of recent HIV infection. The Rapid Test - HIV-1/2 Bio-Manguinhos (Bio-Manguinhos/Fiocruz, Brazil) and the Rapid Check HIV 1&2 (NDI-UFES, Center for Infectious Diseases, Universidade Federal do Espírito Santo) were tested, using 489 samples with HIV positive serology, from blood donors, previously classified as recent or long-term infection by serological testing algorithm for recent HIV seroconversion (STARHS) or LS-HIV Vitros assay methods. The samples were diluted prior to testing (1:50 and 1:100...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: HIV-1 incidence; Detuned assay; Surveillance; Rapid test.
Ano: 2012 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1413-86702012000500009
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Évolution du dispositif de surveillance sanitaire des zones de production de coquillages. Brèves ArchiMer
Palussiere, Mathilde; Favre, Pauline; Riou, Philippe.
Tipo: Text Palavras-chave: Coquillages; Surveillance; Zones de production; Shellfish; Surveillance; Production area.
Ano: 2018 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00430/54176/55517.pdf
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Expertise sur 3 masses d’eau de la Réunion (étangs de Saint-Paul et du Gol) et de Martinique (étang des Salines) : typologie et surveillance DCE ArchiMer
Derolez, Valerie; Giraud, Anaïs.
Trois masses d’eau situées sur le littoral de l’île de la Réunion et de la Martinique présentent des fonctionnements et des caractéristiques atypiques, ce qui pose actuellement des difficultés dans le cadre de l’application de la DCE. Les deux masses d’eau réunionnaises, l’étang du Gol et l’étang de Saint-Paul, sont actuellement identifiées en tant que plans d’eau au titre de la DCE. La masse d’eau martiniquaise, l’étang des Salines, est quant à elle identifiée en tant que masse d’eau de transition. L’objectif de cette étude est d’apporter une expertise, sur la base des données disponibles et des échanges avec les experts locaux et nationaux, concernant : · la typologie des masses d’eau, · les paramètres chimiques, physico-chimiques et biologiques...
Tipo: Text Palavras-chave: Masses d’eau de transition; Typologie; La Réunion; Martinique; DCE; Surveillance.
Ano: 2016 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00335/44573/44289.pdf
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Hydrologie et populations phytoplanctoniques dans le panache de la Loire et en Baie de Vilaine en période estivale : résultats de la campagne VILOIR. ArchiMer
Lunven, Michel; Guillaud, Jean-francois; Crassous, Marie Pierre; Youenou, Agnes; Gohin, Francis; Huret, Martin; Danielou, Marie-madeleine; Kerouel, Roger; Labry, Claire; Aminot, Alain.
Inscrite dans le cadre du Grand Défi Golfe de Gascogne, la campagne VILOIR a été réalisée du 19 au 26 Juin 2003 à bord du Côtes de la Manche avec pour objectif l’étude en période estivale des structures hydrologiques et phytoplanctoniques des panaches de la Loire et de la Vilaine. Elle fait suite, sur la même thématique, à la campagne hivernale NUTRIGAS (2001) et à la campagne printanière GASPROD (2002).
Tipo: Text Palavras-chave: Surveillance; Littoral; Phytoplancton; Phycotoxines; Bretagne; Pays de Loire.
Ano: 2005 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00144/25494/23648.pdf
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Impacts microbiologiques comparés des fleuves côtiers dans le Pertuis Breton 2002-2004. Rapport final ArchiMer
Ryckaert, Mireille; Thomas, Gerard; Derrien, Annick.
Les résultats du réseau REMI et de l’étude de salubrité 1998-2000 contractualisée entre la SRC Ré-Centre-Ouest et l’IFREMER, ont établi la responsabilité de la Sèvre, du Lay et du Curé dans les épisodes de contaminations microbiologiques du pertuis Breton. Toutefois, ces résultats ne permettent pas de préciser le rôle respectif de chaque cours d’eau. Des investigations complémentaires s’avèrent nécessaires pour répondre à cette question. Le présent rapport synthétise l’ensemble résultat acquis au cours de cette étude.
Tipo: Text Palavras-chave: Microbiologie; Surveillance; Réseau REMI; Contamination; Pertuis Charentais; Charente-Maritime.
Ano: 2004 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00140/25081/23189.pdf
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Improving early detection of exotic or emergent oyster diseases in France: identifying factors associated with shellfish farmer reporting behaviour of oyster mortality ArchiMer
Lupo, Coralie; Osta-amigo, Axel; Mandard, Yann-vari; Peroz, Carole; Renault, Tristan.
Farmers’ vigilance is essential for the detection of epidemics, including potential emerging diseases, in marine shellfish. A field study was conducted to investigate oyster farmers’ reporting practices and behaviour, and to identify factors influencing the reporting process of oyster mortality, with the ultimate aim of improving early detection of unexplained oyster mortality outbreaks. A retrospective case-control study of oyster farmers from Charente-Maritime (France) was designed, based on interviews with 27 non-reporting and 89 reporting farmers, further split into 40 formerly-reporting and 49 currently-reporting farmers. Information about farmer and farm characteristics, farming practices, farm health history and related financial compensation on...
Tipo: Text Palavras-chave: Case-control study; Ordinal logistic regression; Surveillance; Notification; Shellfish diseases.
Ano: 2014 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00190/30132/28594.pdf
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Incidence of surgical site infection after craniotomy: comparison between three months and twelve months of epidemiological surveillance BJID
Torres,Silvana; Perdiz,Luciana Baria; Medeiros,Eduardo Alexandrino.
ABSTRACT Objective: To determine the incidence of surgical site infection in patients undergoing craniotomy and to compare 12-month and 3-month post-discharge surveillance periods in terms of their impact on the incidence of surgical site infection in those patients. Methods: This was a retrospective cohort study involving 173 adult patients submitted to “clean” craniotomy, with or without implants, during the six-month period, at a university hospital in the city of São Paulo, Brazil. All the patients were evaluated in the pre-, trans- and postoperative periods and were followed for 12 months to analyze the development of surgical site infections. Results: Of the 173 patients undergoing craniotomy during the study period, 20 developed an surgical site...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Craniotomy; Surgical site infection; Surveillance.
Ano: 2018 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1413-86702018000500433
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Infection of clams by Perkinsus olseni as an example of the new French Surveillance Programme ArchiMer
Miossec, Laurence; Garcia, Celine; Arzul, Isabelle; Francois, Cyrille; Joly, Jean-pierre; Chollet, Bruno; Robert, Maeva; De Blas, Isabelle.
The French network for the surveillance and monitoring of mollusc health (REPAMO) was officially set up in 1992 to control the shellfish status along the French coasts according to the European directives 91/67/EEC and 95/70/EC. The objectives are 1) the surveillance of notifiable diseases present in France (Bonamiosis and Marteiliosis of flat oysters Ostrea edulis), 2) the surveillance of health status of cultured and wild populations of molluscs, 3) the study of abnormal mortality and 4) the control of exchanges from European and third countries. In this context, a new surveillance programme, called Active Targeted Survey, part of the REPAMO, was applied in 2004 in order to improve the monitoring of the health status of the French mollusc populations...
Tipo: Text Palavras-chave: Surveillance; Bivalvia; Clams; Perkinsus olseni; Pathogen; Pathology.
Ano: 2006 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2006/acte-6376.pdf
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Influenza virus surveillance among young children in São Paulo, Brazil: the impact of vaccination BJM
Cabeça,Tatiane Karen; Watanabe,Aripuanã; Moreira,Luciana Peniche; Melchior,Thaís Boim; Perosa,Ana Helena; Camargo,Clarice; Parmezan,Sheila Negrini; Bellei,Nancy.
This study assessed the presence of influenza virus among young children and the coverage of vaccination from 2010 to 2012 in São Paulo, Brazil. Our results demonstrated a lower rate of influenza detection and a predominance of influenza B. A decrease of coverage vaccination through the surveillance periods was observed.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Influenza virus; Surveillance; Vaccination.
Ano: 2014 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1517-83822014000300047
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Introduction de radionucléides dans le milieu marin et impacts. Sous-région marine Golfe de Gascogne. Evaluation initiale DCSMM. ArchiMer
AAMP, Équipe de coordination DCSMM.
Tipo: Text Palavras-chave: Golfe de Gascogne; Radionucléides; Rejets; Surveillance; Teneurs environnementales.
Ano: 2012 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00329/44054/43625.pdf
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Introduction de radionucléides dans le milieu marin et impacts. Sous-région marine Manche - Mer du Nord. Evaluation initiale DCSMM. ArchiMer
AAMP, Équipe de coordination DCSMM.
Tipo: Text Palavras-chave: Manche; Mer du Nord; Radionucléides; Rejets; Surveillance; Teneurs environnementales.
Ano: 2012 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00327/43868/81045.pdf
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Introduction de radionucléides dans le milieu marin et impacts. Sous-région marine Méditerranée occidentale. Evaluation initiale DCSMM. ArchiMer
Boissery, Pierre; Thébault, Hervé.
Tipo: Text Palavras-chave: Méditerranée; Radionucléides; Rejets; Surveillance; OPERA; RINBIO; Teneurs environnementales.
Ano: 2012 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00331/44237/81036.pdf
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Introduction d’organismes pathogènes pour les espèces exploitées. Sous-région marine Golfe de Gascogne. Evaluation initiale DCSMM. ArchiMer
Renault, Tristan; Guichard, Benjamin; Castric, Jeannette.
Tipo: Text Palavras-chave: Golfe de Gascogne; Organismes pathogènes; Surveillance; Détection; Repamo.
Ano: 2012 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00329/44063/43634.pdf
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Introduction d’organismes pathogènes pour les espèces exploitées. Sous-région marine Manche - mer du Nord. Evaluation initiale DCSMM. ArchiMer
Renault, Tristan; Guichard, Benjamin; Castric, Jeannette.
Tipo: Text Palavras-chave: Manche; Mer du Nord; Organismes pathogènes; Surveillance; Détection; Repamo.
Ano: 2012 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00328/43876/43450.pdf
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Introduction d’organismes pathogènes pour les espèces exploitées. Sous-région marine Méditerranée occidentale. Evaluation initiale DCSMM. ArchiMer
Renault, Tristan; Guichard, Benjamin.
Tipo: Text Palavras-chave: Méditerranée; Organismes pathogènes; Surveillance; Détection; Repamo.
Ano: 2012 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00331/44246/80281.pdf
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Inventaire et délimitation cartographique des bassins hydrologiques du littoral français métropolitain ArchiMer
Belin, Catherine.
Ce rapport rassemble les 119 cartes délimitant les 119 bassins hydrologiques littoraux de l'ensemble des côtes de France de Dunkerque à Menton et la Corse. Ce découpage de la côte en bassins hydrologiques est utilisé dans le cadre des réseaux de suivi phytoplanctonique et microbiologique en vue de la collecte et du traitement des données. L'utilisation de la cartographie IGN permet d'identifier les communes littorales concernées par les bassins hydrologiques littoraux ainsi délimités.
Tipo: Text Palavras-chave: Hydrologie; Suivi; Surveillance; Tracé de côte.
Ano: 1990 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00450/56189/57745.pdf
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Journées Rémi des 23 et 24 novembre 1998 - Réseau de contrôle microbiologique (Rémi) et surveillance microbiologique ArchiMer
Catherine, Martial.
Ce document est un rapport de synthèse des présentations faites lors des journées REMI, tenues à Nantes les 23 et 24 novembre 1998. Les exposés de la première journée sont principalement destinés aux actions visant à améliorer le fonctionnement du réseau REMI. Ils concernent les sujets suivants : bilan de la mise en oeuvre du réseau de contrôle REMI en 1998 (nouvelle version), bilan de l'état d'avancement du plan qualité surveillance microbiologique et du programme Malthus (méthodologie, normalisation), approches préliminaires pour la détermination des fréquences d'échantillonnage en vue de la surveillance régulière des zones de production classées. La seconde journée est dédiée aux études conduites par les laboratoires côtiers, dont les procédures sont...
Tipo: Text Palavras-chave: REMI; Réseau; Surveillance; Microbiologie; Quadrige; Assurance qualité; AFNOR; Impédancemétrie; Rejets agricoles; Station d'épuration; Bateaux de plaisance; Oiseaux; Huîtres; Moules; Tellines; Eaux littorales; Coliformes fécaux; E. coli; Streptocoques fécaux; Bactériophages.
Ano: 1999 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00040/15157/12493.pdf
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Journées REPHY 1998. Gestion du risque Dinophysis / DSP. Seuils déclencheurs des tests de toxicité pour les différentes espèces toxiques ArchiMer
Beliaeff, Benoît; Belin, Catherine.
Ce document est le premier rapport de la synthèse des présentations faites au cours des journées REPHY 1998. Celles-ci se sont déroulées à Nantes du 18 au 20 mars et ont réuni plus de 50 participants. Les sujets abordés dans ce premier rapport concernent l'amélioration possible de a gestion du risque lié à la présence de Dinophysis dans les eaux littorales, suite à un traitement des données REPHY sur une dizaine d'années. Des explications détaillées des traitements préliminaires réalisés sur ces données sont également fournies.
Tipo: Text Palavras-chave: REPHY; Réseau; Surveillance; Oinophysis; Toxines DSP; Données; QUADRIGE.
Ano: 1999 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00040/15156/12491.pdf
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